Pingviiniä ohjataan klikkaamalla hiirellä kentän kohtaa, johon halutaan suunnata. Myös ovesta sisälle mennään klikkaamalla. Pingviinit kävelevät kuin oikeat pingviinit. Joihinkin paikkoihin voi päästä vain kartan kautta, ja jotkut paikat ovat löydettävissä vain tiettyinä päivinä.
Kaikilla pelaajilla on oma iglunsa, jota rekisteröitynyt ja jäsenmaksua maksava pelaaja voi myös sisustaa. Muut pelaajat voivat mennä rekisteröitymättömän pelaajan igluun vain, jos pelaaja on merkitty ystäviin. Ainoastaan jäsenet voivat tehdä omasta iglustaan kaikille vapaakulkuisen sekä ostaa sinne tavaroita.
Club Penguinissa järjestetään ajoittain juhlia, jolloin lähes koko pelimaailma on koristeltu. Silloin peliin ilmestyy paikkoja, joihin pääsevät vain jäsenet. Agenteilla on oma salainen päämaja, EPF command room, jossa he voivat tehdä agenttitehtäviä. Agentiksi pääsemiseen vaaditaan testin suorittaminen.
